Al inicio de la Q2, Aron Canet se cayó en la curva 10. Poco después, Barry Baltus se puso líder con un tiempo de 1:58.852, seguido por Manuel González (Intact), Jake Dixon e Izan Guevara (cuyo tiempo de vuelta se redujo poco después debido a las limitaciones de la pista). Antes de la carrera checa, el líder del campeonato, Manuel González, se encuentra a nueve puntos de su rival más cercano, Aron Canet. Canet haría bien en empezar lo más cerca posible de su rival. El español lo dio todo, volviendo frenéticamente a su moto a dos minutos del final, pero su esfuerzo no fue suficiente. Canet perdió por poco la oportunidad de marcar un tiempo, al no cruzar la meta a tiempo. El 18.º puesto, por lo tanto, fue para el subcampeón.
Mientras tanto, Joe Roberts, del equipo American Racing, adelantó a Baltus, quien fue reemplazado de nuevo por Baltus. ¡Y finalmente, la pole position fue para el belga! Detrás de él: Roberts y su compañero de equipo Marcos Ramírez, luego González, y por delante de su compañero de equipo en Intact, Senna Agius (6.º puesto), Dani Holgado.
El piloto local, Filip Salac, terminó noveno en la parrilla ante su afición.